L'atlas des champignons du sol permet d'appréhender leur diversité dans les sols français

Atlas moléculaire des champignons du sol

France Education de qualité Vie terrestre

Étude moléculaire des champignons du sol

L’équipe de recherche BIOCOM de l’UMR Agroécologie du centre INRAe de Dijon développe depuis plus de 20 ans des thématiques de recherche portant sur une meilleure description de la distribution spatiale à grande échelle de la diversité microbienne du sol ainsi qu’une meilleure compréhension des processus écologiques déterminant ces profils de distribution afin de hiérarchiser les facteurs environnementaux impliqués.

À ce jour, les résultats sur l’abondance et la diversité des communautés de champignons ont été obtenus via différents projets (Ademe/région Bourgogne FungiMIC-RMQS, AgroEcoSol PIA 3 Ademe) et une collaboration forte avec le Genoscope (Evry, CEA/CNRS). Ces résultats sont en cours de valorisation d’un point de vue académique via différentes publications scientifiques internationales à comité de lecture.

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Le Fonds de dotation ROullier s'engage auprès de INRAe pour la création d'un atlas français des champignons du sol
Coupe de sol pour l'atlas des champignons du sol

L’Atlas Moléculaire Français des Champignons du Sol

Le Fonds de dotation Roullier, l’ADEME, l’Office Français de la Biodiversité et TMCE, soutiennent l’équipe de recherche en vue d’élaborer un « Atlas moléculaire français des champignons du sol » sur le modèle de l’Atlas développé pour les bactéries en 2018. La France sera ainsi le seul pays à pouvoir afficher un ensemble d’ouvrages complémentaires sur la microbiologie des sols à l’échelle de son territoire national.

Auteurs et responsables scientifiques du projet :

  • Christophe Djemiel (Auteur, Coordinateur de la rédaction de l’Atlas)
  • Sébastien Terrat (Auteur, Responsable scientifique)
  • Samuel Dequiedt (Auteur)
  • Claudy Jolivet (Auteur)
  • Pierre-Alain Maron (Auteur)
  • Lionel Ranjard (Auteur, Responsable scientifique)

L’objectif de ce projet est d’aller plus loin dans la valorisation des résultats obtenus sur la diversité fongique des sols français en produisant un ouvrage naturaliste à destination du grand public. Cet ouvrage de synthèse apportera des informations sur l’écologie des communautés fongiques et décrira les différents groupes fongiques observés dans les sols français, leur distribution spatiale, leurs exigences écologiques et leurs interactions.


Christophe Djemiel, Chercheur Post-doc INRAe, Coordinateur de la rédaction de l’Atlas